Книгата на проф. д-р Иван Денев "Българската православна църква под комунистическа власт (1944-1989)" е трета част от неговото документално изследване. В тях авторът разглежда взаимоотношенията между Църквата и Държавата в България по времето на социализма. Изследването включва нови материали за Българската православна църква. То обхваща главно:

• Архива на МВнР, фонд 10 (Дирекция по Вероизповеданията) и
• Централния държавен архив (ЦДА).

В книгата "Възрожденски проповеди в Архива на Рилския манастир" авторите Иван Денев и Андриан Александров обнародват и анализират проповедите от архива на Рилския манастир от епохата на Възраждането. Изданието включва 66 проповеди от различни автори от епохата на Българското Възраждане. Проповедите са открити в манастирския архив и се публикуват за първи път.

В Годишник на Софийския университет "Св. Климент Охридски" Богословски факултет, Том 1, 1993

Книгата на проф. д-р Иван Денев "Комунистически диктат върху Българската православна църква (1944-1960)" е първа част от неговото документално изследване в четири тома. В него авторът разглежда взаимоотношенията между Църква и Държава в комунистическа България в периода 1944-1989 година.

Книгата “Оперативни действия на комунистическата власт срещу служителите на Българската православна църква” е четвърта (последна) част от документалната поредица за взаимоотношенията между Църква и Държава в комунистическа България в периода 1944-1989 година. В книгата са публикувани характеристиките, давани на служителите на Българската православна църква, разпределени по околии в три групи: опасни, по-малко опасни и безопасни.

Книгата на проф. д-р Иван Денев "Чеда на социализма (Документално четиво)" е четвърта част от неговия документален труд върху отношенията между Църква и Държава в България (1944-1989 г.). Изданието се базира върху богат архивен материал за периода. Книгата съдържа нови материали за това как български архиереи, свещеници и мирски лица, членове на БПЦ, са вербувани от ДС. Много от тях, като членове и на БКП, работят "за строителството на социализма".